Bioinformatics

How much?

シーケンサーの値段・性能まとめ(一例)

会社 機種 性能 (Gb) 価格 価格 (run)
Illumina MiniSeq 7.5 $50,000
MiSeq 15 $100,000 ~10,0000円
NextSeq 120 $250,000
Hiseq 1500 $740,000
HiSeq X 1800 (フローセル2枚分) $1,000,000 $1000 / hs genome 30x ?

Reference

(16.06.04時点調べ、コメント歓迎)

Differential gene expression analyses

edgeR

Cuffdiff

DEseq2

Go enrichment